In silico

In silico

In silico es una expresión que significa "hecho por computadora o via simulación computacional". La frase está acuñada a partir de las frases in vivo e in vitro del latín, las cuales son comúnmente usadas en biología, más comúnmente en temas de biología de sistemas, y se refieren a experimentos hechos en organismos vivos o fuera de organismos vivos, respectivamente. Al contrario de lo que comúnmente se cree, in silico no significa nada en latín. Sin embargo por su relación con "in silicium" se traduce por "en silicio" lo cual hace referencia al material del que estan hechos los semiconductores que permiten almacenar información en el computador.

Contenido

Historia del término

La expresión in silico fue usada por primera vez en público en 1989 en el taller Autómata Celular: Teoría y Aplicaciones, en Los Álamos, Nuevo México. Pedro Miramontes, un matemático de la Universidad Nacional Autónoma de México, presentó un informe “Restricciones fisioquímicas del ADN y el ARN, automata celular y evolución molecular”. En su charla, Miramontes usó el término “In silico” para caracterizar experimentos biológicos llevados a cabo enteramente en un computador. El trabajo fue presentado posteriormente por Miramontes como su tesis doctoral.[1]

In silico se ha usado en libros blancos realizados para apoyar la creación de programas sobre genoma bacterial por la Comisión de la Comunidad Europea. El primer documento referenciado donde aparece "in silico" fue escrito por un equipo francés en 1991.[2] Su primera aparición referenciada en un libro se trata de un trabajo de Hans B. Sieburg de 1990, presentado en una escuela de verano sobre sistemas complejos en el Santa Fe Institute.[3] La expresión "in silico" fue usada por primera vez en público en 1989 en el taller “Autómata Celular: Teoría y Aplicaciones”, en Los Álamos, Nuevo México. Pedro Miramontes, un matemático de la Universidad Nacional Autónoma de México, presentó un informe “Restricciones fisioquímicas del ADN y el ARN, automata celular y evolución molecular”. En su charla, Miramontes usó el término “In silico” para caracterizar experimentos biológicos llevados a cabo enteramente en un computador. El trabajo fue presentado posteriormente por Miramontes como su tesis doctoral.[1]

"In silico" versus "in silicio"

Hubo por un tiempo el intento de reemplazar "in silico" por "in silicio", que es la expresión latina correcta para “en silicio”. El término latino para “silicio”, “silicium”, fue creado a comienzos del siglo XIX por Berzelius. Sin embargo, “in silico” tuvo más acogida y hoy es un término casi universal, recogiéndose, incluso, como título de una revista especializada (In Silico Biology: http://www.bioinfo.de/isb/).

La expresión "in silico" se ha aplicado desde el principio sólo a las simulaciones por ordenador que modelaban procesos naturales o de laboratorio (de cualquier ciencia natural), y no hace referencia a cálculos genéricos realizados por ordenador.

Referencias

  1. Miramontes P. Un modelo de autómata celular para la evolución de los ácidos nucleicos [A cellular automaton model for the evolution of nucleic acids]. Tesis de doctorado en matemáticas. UNAM. 1992.
  2. Danchin A, Medigue C, Gascuel O, Soldano H, Henaut A. From data banks to data bases. Res Microbiol. 1991 Sep-Oct;142(7-8):913-6. PMID 1784830.
  3. Sieburg, H.B. (1990). Physiological Studies in silico. Studies in the Sciences of Complexity 12, 321-342.

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Véase también


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